カトリック別府教会は、カトリック大分司教区の管轄で、1950年にサレジオ修道会によって建立され、運営されています。 聖フランシスコ・ザビエル渡来400年記念に際して、1950年12月17日に落成しました。 フランスのルルドにある教会を模して建てられました。
聖堂は通常7：00〜18：00まで開いており、どなたでも自由に入ることができます。 敷地内に海の星幼稚園がある為、門は閉まっていますが、声をかけると聖堂を自由に見学させて頂けました。